Approches innovantes pour la caractérisation des banques de graines de mauvaises herbes
Description
La détection précoce des mauvaises herbes, lorsqu'elles sont encore présentes sous forme de graines dans les sols agricoles, constitue un outil de choix pour élaborer ou ajuster les programmes de phytoprotection avant que ces mauvaises herbes ne prolifèrent. À l'heure actuelle, deux méthodes sont principalement utilisées pour identifier la composition des banques de graines, soit la méthode d'émergence des plantules (qui consiste à mettre en culture des sols, puis à identifier les plantules en croissance) et la méthode par microscopie (qui consiste à extraire les graines du sol par tamisage, puis à les identifier à la loupe binoculaire). Ces méthodes exigent toutefois beaucoup de temps, demandent une expertise pointue, ou possèdent différents biais méthodologiques.
Le développement des outils moléculaires pourrait permettre de concevoir de nouvelles méthodes, rapides et fiables, pour caractériser les banques de graines de mauvaises herbes dans les sols agricoles, mais elles restent à mettre au point. L'objectif de ce projet est d'évaluer la performance des outils moléculaires pour caractériser les banques de graines de mauvaises herbes comparativement aux méthodes classiques d'émergence des plantules et par microscopie.
L'étudiante ou l'étudiant du projet sera notamment en charge 1) d'effectuer des caractérisations de banques de graines à l'aide de la méthode d'émergence des plantules et de la méthode par microscopie, 2) de collaborer aux analyses de séquençage à haut débit, et 3) de comparer par analyses statistiques les résultats obtenus à l'aide des trois méthodes à l'étude.
Le projet sera supervisé par Bérenger Bourgeois, professeur adjoint au Département de phytologie de l'Université Laval, co-supervisé par Élise Smedbol, chercheure à l'Institut de recherche et de développement en agroenvironnement (IRDA), et mené en étroite collaboration avec le Laboratoire d'expertise et de diagnostic en phytoprotection du MAPAQ.
Le projet de maitrise débutera en septembre 2024.
Domaines de recherche
- Malherbologie
- Productions végétales
- Bio-informatique
Directeur de recherche
Bérenger Bourgeois
Milieu de recherche
Département de phytologie, Faculté des sciences de l'agriculture et de l'alimentation, Université Laval
Le Département de phytologie a pour mission de favoriser l'exploitation rationnelle et durable des ressources végétales par l'être humain. Il s'acquitte de cette mission en formant des professionnels compétents et en contribuant, par ses activités de recherche, à l'avancement des sciences végétales.
Site web
Soutien financier disponible par programme d’études
Maîtrise en biologie végétale - avec mémoire
Description du programmeSoutien financier disponible*
Financement en lien avec le projet de recherche
18000$ par année pendant 2 années.
Financement en lien avec le programme d'études
Bourses de réussite
| Étapes |
Prime |
| Présentation du projet de recherche ET remise du plan de collaboration |
500$ |
| Dépôt initial du mémoire |
1 000$ |
| Total |
1 500$ |
Financement en lien avec l'Université Laval
* Présentation du soutien financier maximal disponible. Certaines conditions s'appliquent. Sujet à changement sans préavis. Pour plus d'information, renseignez-vous auprès des organismes responsables.
Profil recherché
- Agronomie
- Biologie
- Bioinformatique
Exigences et conditions
- Baccalauréat en agronomie, en biologie, ou en microbiologie
- Intérêt pour la malherbologie et les productions végétales
- Goût pour le travail expérimental
- Connaissances en analyses statistiques à l'aide du logiciel R
- Première expérience en recherche scientifique (atout)
Documents exigés
- Lettre de motivation
- Curriculum vitæ
- Relevé de notes
Pour déposer votre candidature, veuillez faire parvenir une lettre de présentation expliquant vos intérêts, un CV et une copie de vos relevés de notes universitaires accompagnés des coordonnées de trois références avant le 1er juin 2024 à Bérenger Bourgeois à l'adresse berenger.bourgeois.1@ulaval.ca
Date limite pour postuler
1 juin 2024
Pour plus d'information
Bérenger Bourgeois
Professeur adjoint
Département de phytologie
berenger.bourgeois.1@ulaval.ca