Mise en place d'un programme de sélection génétique chez la mouche soldat noire (Hermetia illucens) pour l'optimisation du surcyclage des résidus organiques

Description

L'industrie des insectes comestibles connaît une croissance rapide au Québec et à l'international, portée par les besoins en protéines durables et les principes de l'économie circulaire. Parmi les espèces d'intérêt, la mouche soldat noire (Hermetia illucens) se distingue par sa capacité exceptionnelle à valoriser une large gamme de résidus organiques et par sa croissance rapide.

La production à grande échelle de cette espèce représente une solution prometteuse pour la valorisation des déchets alimentaires, en transformant ces derniers en biomasse riche en protéines et en nutriments. Toutefois, afin de répondre aux volumes croissants de résidus et d'améliorer la compétitivité du secteur, il est essentiel d'optimiser les performances biologiques des populations élevées.

Jusqu'à présent, la majorité des travaux se sont concentrés sur les conditions environnementales (température, humidité, lumière). En revanche, les approches de sélection génétique restent peu développées, notamment en ce qui concerne la gestion de la consanguinité. Or, un contrôle inadéquat de celle-ci peut entraîner un effondrement rapide des colonies en quelques générations.

Ce projet vise donc à développer une approche intégrée combinant sélection génétique quantitative et outils génomiques afin d'assurer la performance et la durabilité des élevages de mouche soldat noire en contexte industriel.

Objectifs du projet

Le projet a pour objectif général de mettre en place un programme de sélection génétique robuste en milieu industriel, tout en assurant une gestion efficace de la consanguinité.

Plus spécifiquement:
1. Développer un noyau de sélection basé sur la performance larvaire.
a. Assurer une diversité génétique initiale élevée.
b. Mettre en place des méthodes de phénotypage adaptées à la production de masse.
c. Élaborer des plans d'accouplement optimisés pour limiter la consanguinité.
d. Estimer les paramètres génétiques (héritabilité, réponse à la sélection).
2. Développer une méthode non destructive d'extraction d'ADN.
a. Applicable aux stades larvaire et adulte.
b. Compatible avec les contraintes de production commerciale.
3. Développer un panel de marqueurs SNP.
a. Permettant l'assignation de parenté.
b. Facilitant le suivi de la consanguinité en population.

La personne recrutée sera amenée à:
- Concevoir et mettre en œuvre un programme de sélection génétique en conditions expérimentales et industrielles.
- Collecter et analyser des données phénotypiques à grande échelle.
- Développer et optimiser des protocoles d'extraction d'ADN non destructifs.
- Réaliser des analyses génomiques (GBS, SNP calling, assignation de parenté).
- Mettre en place des stratégies de gestion de la consanguinité (plans d'accouplement, modèles génétiques).
- Analyser les données à l'aide d'outils statistiques et bio-informatiques.
- Collaborer avec des partenaires industriels et académiques.
- Participer à la rédaction d'articles scientifiques et à la diffusion des résultats auprès du secteur.

Exigences et conditions

Exigences essentielles
- Diplôme de maîtrise en sciences animales, génétique, bio-informatique ou domaine connexe.
- Intérêt marqué pour la génétique quantitative et/ou la génomique.
- Bonnes compétences en analyse de données (R, Python ou équivalent).
- Capacité à travailler en équipe et avec des partenaires industriels.
- Excellentes compétences en communication scientifique (français et/ou anglais).
- Aptitude à travailler sur les insectes (élevage et échantillonnage).

Atouts
- Expérience en sélection animale ou en génétique des populations.
- Expérience en élevage d'insectes ou en systèmes de production animale.
- Intérêt pour l'économie circulaire et les systèmes alimentaires durables.

Date limite pour postuler

1 juillet 2026